Vigilancia metagenómica de SARS-CoV-2 en aire y superficies en el ambiente urbano chileno

Abstract

Esta propuesta estudiará la emergencia y dinámica de variantes de SARS-CoV-2 en comparación con otros virus de RNA en superficies y aire en espacios públicos urbanos. La propuesta se enmarca en la iniciativa global www.metasub.org, donde se caracteriza la microbiota del espacio urbano en más de 60 ciudades. Actualmente, hemos tomado muestras en siete comunas de la región metropolitana, en superficies de alto contacto (cajeros automáticos; metro y buses), durante cinco semanas consecutivas. Además, hemos generado resultados preliminares que demuestran que podemos recuperar SARS-CoV-2 y otros virus de RNA. Con la intención de apoyar la implementación de medidas sanitarias, proponemos profundizar en tres aspectos: 1. Incluir muestras de aire al estudio para maximizar la detección de variantes en circulación, 2. Extender el periodo de monitoreo para capturar la variabilidad estacional de SARS-CoV-2, y 3. Extender el estudio a otras regiones para tener una visión comparada de la dinámica viral. En breve, las muestras serán categorizadas de acuerdo a su positividad y serán secuenciadas y analizadas. Los productos de este estudio serán: genomas de SARS-CoV-2 accesibles desde GISAID y un modelo epidemiológico de variabilidad temporal y espacial del virus.